巩纯秀学术兼职中华医学会儿科内分泌遗传代谢学组副组长，中华医学会糖尿病学会委员，中华医学会糖尿病学会1型糖尿病学组副组长，北京医学会儿科分会内分泌遗传代谢学组组长，中华医学会糖尿病学分会北京分会委员，原亚太儿科内分泌学会理事会理事，中国医师协会内分泌代谢学分会常委。中华儿科杂志编委,中华医药杂志常务编委，中华糖尿病杂志编委，中国糖尿病杂志编委，中国实用儿科杂志编委，中国小儿急救医学编委，免疫分析与临床杂志编委，柳叶刀糖尿病内分泌中文版编委。
巩纯秀，首都医科大学附属北京儿童医院，内分泌遗传代谢科，主任医师，博士，教授，博导。临床擅长糖脂代谢疾病（儿童1型糖尿病、2型糖尿病、肥胖、低血糖、高血压、特殊类型糖尿病）生长及骨代谢（身材矮小、佝偻病、甲状旁腺疾病、发育迟缓）性腺及肾上腺疾病（性早熟、DSD（性发育异常）等。
儿童内分泌科主要看的是儿童发育中分泌的问题和基础代谢疾病方面的问题。如果儿童发育中分泌过多会导致巨人症和肢端肥大症，如果生长缺乏或严重分泌不足就会出现矮小，如果孩子的性分泌异常，可能会出现性早熟，这是儿童内分泌的常见疾病。如果是基础代谢疾病有问题，如儿童糖尿病和甲状腺疾病，这也是儿童内分泌科的常规诊断和。
多年来，为方便患者就医，医院始终坚持24小时接诊。北京儿童医院积极践行公立医院改革，推进预约挂号工作，优化服务流程，改善患者就医体验，受到国家卫生健康委的肯定和广大群众的认可。医院还承担了上级部门委派的重大儿童传染病防治、抗震救灾支援、突发公共卫生事件救治等医疗任务。