关税保函（Guarantee for the Customs Duties）是指担保银行应进口商（含加工贸易企业）的申请而向海关出具的、保证进口商履行缴纳关税义务的书面文件。关税保函主要包括两种类型，即关税保付保函、加工贸易税款保付保函。
保函的有效期通常从开立之日起到工程合同预计竣工日期延长3个月为止。如果工程未按时完工，申请人在保函到期前需要办理延期手续。当工程项目出现拖欠农民工工资的情况时，由人社部门和行业主管部门共同出具书面通知，启动保函赔付程序。金融机构需要在收到通知后的3个工作日内划拨资金至指定的账户，用于支付拖欠的工资。
商业保函指的是，除了银行以外，由其他商业机构出具的保函，一般出具保函的公司都是专业的担保机构或商业机构的信用担保。商业保函也是包括了很多种的，比如预付款保、农民工工资支付保函、质量保函、投标保函、履约保函等，这些都是属于商业保函。
预付款保函（advance payment guarantee）承包人要求银行向业主(发包人) 出具的保证业主所支付的工程预付款用于实施项目的一种信用函件。投标人在中标后签订的合同中规定，承包人委托银行向业主出具的由业主按合同规定向承包人支付一笔工程预付款，及时用于实施项目的保证函件（即A委托B向C作出担保，担保内容是C按合同约定向A支付的预付款确实在用于项目的实施）。担保银行应为业主所接受。如承包人不履约，业主可凭保函向担保银行索赔。